Hva er forskjellen mellom 16s rRNA og 18s RRNA?
Hva er forskjellen mellom 16s rRNA og 18s RRNA?

Video: Hva er forskjellen mellom 16s rRNA og 18s RRNA?

Video: Hva er forskjellen mellom 16s rRNA og 18s RRNA?
Video: РНК структура, типы и функции 2024, November
Anonim

Hoved forskjell mellom utføre analyser med 18S rRNA gendata i stedet for 16S rRNA gendata (eller ITS-data) er referansedatabasen som brukes for OTU-plukking, de taksonomiske tilordningene og den malbaserte justeringen, siden den må inneholde eukaryote sekvenser.

Med tanke på dette, hvorfor brukes 16s rRNA-genet til identifikasjon?

De 16S ribosomalt RNA-gen koder for RNA-komponenten til 30S-underenheten til det bakterielle ribosomet. På grunn av kompleksiteten til DNA-DNA-hybridisering, 16S rRNA-gen sekvensering er brukt som et verktøy for å identifisere bakterier på artsnivå og hjelper til med å skille mellom nært beslektede bakteriearter [8].

I tillegg, har eukaryoter 16s rRNA? De 16S rRNA genet er tilstede i alle bakterier, og en beslektet form forekommer i alle celler, inkludert de av eukaryoter.

Spørsmålet er også, hva er 18s og 28s rRNA?

De 28S / 18S ribosomalt RNA ratio brukes ofte for å vurdere kvaliteten på totalt RNA renset fra en gitt prøve. Hos mennesker, 28S rRNA har ~5070 nukleotider, og 18S har 1869 nukleotider, som gir en 28S / 18S forhold på ~2,7. En høy 28S / 18S forholdet er en indikasjon på at det rensede RNA er intakt og ikke har blitt degradert.

Hva er 16s rRNA-sekvensering?

16S rRNA genet sekvens analyse er en standardmetode innen bakteriell taksonomi og identifikasjon, og er basert på påvisning av sekvens forskjeller (polymorfismer) i de hypervariable regionene i 16S rRNA gen som finnes i alle bakterier.

Anbefalt: